Codex

CO-Detection by indEXing CODEX

  • Méthode automatisée 
  • Analyse spatiale des marqueurs protéiques sur une unique coupe de tissu
  • Tissu congelé (humain, souris) ou paraffiné (humain)
  • Détection simultanée de plus de 40 protéines
  • Pas d’étape de stripping (intégrité du tissu préservée)
  • Pas de cross réactivité codex

Technologie CODEX

  • Chaque anticorps du panel est conjugué à un unique code-barre oligonucléotidique  
  • Le tissu est marqué en 1 seule étape de marquage avec le panel d’anticorps 
  • Détection hautement spécifique des code-barres grâce à des séquences complémentaires couplées à un fluorochrome 
  • Séparation spectrale des marquages  
codex

Workflow

  • Run CODEX : multicycles d’acquisition 
  • Par cycle, 3 reporters s’hybrident à leur code-barre complémentaire
  • Pour chaque canal de fluorescence : le fluorochrome est excité et le signal fluorescent émis est capté sur caméra
  • Hybridation anticorps CODEX / reporter réversible = révélation séquentielle des anticorps CODEX
codex

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Mis à jour le 05 mai 2022.
https://micropicell.ppksup.univ-nantes.fr/fr/multiplex/codex-phenocycler